MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_5

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009791	CAAA	2	8	1416	1423	75 %	0 %	0 %	25 %	157149576
2	NC_009791	A	6	6	1421	1426	100 %	0 %	0 %	0 %	157149576
3	NC_009791	GCCA	2	8	2702	2709	25 %	0 %	25 %	50 %	157149577
4	NC_009791	T	7	7	2727	2733	0 %	100 %	0 %	0 %	157149577
5	NC_009791	GAA	2	6	2749	2754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149577
6	NC_009791	CAA	2	6	2826	2831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149577
7	NC_009791	AC	3	6	2835	2840	50 %	0 %	0 %	50 %	157149577
8	NC_009791	CTGA	2	8	2892	2899	25 %	25 %	25 %	25 %	157149577
9	NC_009791	CGCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	157149575
10	NC_009791	TGC	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149575
11	NC_009791	CTG	2	6	3154	3159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149575
12	NC_009791	TTC	2	6	3472	3477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149575
13	NC_009791	TTC	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149575
14	NC_009791	CCGC	2	8	3511	3518	0 %	0 %	25 %	75 %	157149575
15	NC_009791	CAT	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149575
16	NC_009791	TCCT	2	8	3611	3618	0 %	50 %	0 %	50 %	157149575
17	NC_009791	TGC	2	6	3620	3625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149575
18	NC_009791	ATC	2	6	3626	3631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149575
19	NC_009791	TCG	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149575
20	NC_009791	CT	4	8	3795	3802	0 %	50 %	0 %	50 %	157149575
21	NC_009791	TTC	2	6	3873	3878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149575
22	NC_009791	CCG	2	6	3879	3884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149575
23	NC_009791	GTTTC	2	10	4036	4045	0 %	60 %	20 %	20 %	157149575
24	NC_009791	CGG	2	6	4074	4079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149575
25	NC_009791	GTA	2	6	4166	4171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149575
26	NC_009791	GCC	2	6	4231	4236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149575
27	NC_009791	CCAC	2	8	4252	4259	25 %	0 %	0 %	75 %	157149575
28	NC_009791	T	7	7	4275	4281	0 %	100 %	0 %	0 %	157149575
29	NC_009791	CGG	2	6	4337	4342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149575
30	NC_009791	TTC	2	6	4383	4388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149575
31	NC_009791	CTT	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149575
32	NC_009791	CAG	2	6	4475	4480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149575
33	NC_009791	ATC	2	6	4533	4538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149575

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.